Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms