Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TPRNQ4KMQ1 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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