Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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