Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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