Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIXQ14938 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms