Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RBM42Q9BTD8 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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