Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
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