Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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