Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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GTF3C1Q12789 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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GTF3C1Q12789 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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GTF3C1Q12789 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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GTF3C1Q12789 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
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GTF3C1Q12789 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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GTF3C1Q12789 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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GTF3C1Q12789 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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GTF3C1Q12789 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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