Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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PTPRBP23467 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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PTPRBP23467 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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PTPRBP23467 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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PTPRBP23467 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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PTPRBP23467 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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PTPRBP23467 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
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PTPRBP23467 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
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PTPRBP23467 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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PTPRBP23467 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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PTPRBP23467 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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PTPRBP23467 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
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