Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms