Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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