Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms