Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRDNQ13061 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms