Protein–RNA interactions for Protein: O00562

PITPNM1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, humanhuman

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Length 1,244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM1O00562 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PITPNM1O00562 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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