Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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