Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 RAI14-220ENST00000512629 2941 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 CD200R1-202ENST00000308611 2299 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 LIPG-201ENST00000261292 10441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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RNF39Q9H2S5 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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RNF39Q9H2S5 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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RNF39Q9H2S5 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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RNF39Q9H2S5 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 SOX6-202ENST00000396356 8865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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