Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms