Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02334-201ENST00000617568 4959 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABCA4-201ENST00000370225 7309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF225-201ENST00000262894 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR8H1-203ENST00000641600 2927 ntAPPRIS P2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TP53BP1-201ENST00000263801 6346 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 IPO11-201ENST00000325324 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC4C-202ENST00000527150 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBTB43-203ENST00000449886 5851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTNND1-221ENST00000529873 5931 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTNND1-227ENST00000530748 5925 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01748-202ENST00000634281 2864 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEACAM5-210ENST00000617332 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008555.1-201ENST00000561778 2757 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUPT16H-201ENST00000216297 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR87-202ENST00000447313 9009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 DRP2-202ENST00000395209 7277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 C20orf194-201ENST00000252032 6869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIVEP2-203ENST00000367604 10032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIMCH1-218ENST00000513024 5129 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD200R1-202ENST00000308611 2299 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRDM11-206ENST00000622142 10730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 NSD2-207ENST00000398261 8390 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPS23-201ENST00000313608 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLDN12-201ENST00000287916 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 DROSHA-201ENST00000344624 5102 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms