Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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