Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
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RTL8BQ17RB0 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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RTL8BQ17RB0 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
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RTL8BQ17RB0 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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RTL8BQ17RB0 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
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RTL8BQ17RB0 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
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RTL8BQ17RB0 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
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RTL8BQ17RB0 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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RTL8BQ17RB0 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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RTL8BQ17RB0 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RTL8BQ17RB0 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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