Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
FOXD1Q16676 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
FOXD1Q16676 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
FOXD1Q16676 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
FOXD1Q16676 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
FOXD1Q16676 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
FOXD1Q16676 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
FOXD1Q16676 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
FOXD1Q16676 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
FOXD1Q16676 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms