Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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CKAP5Q14008 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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CKAP5Q14008 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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CKAP5Q14008 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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CKAP5Q14008 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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CKAP5Q14008 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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