Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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PKP1Q13835 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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PKP1Q13835 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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PKP1Q13835 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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PKP1Q13835 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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