Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
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SP140Q13342 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SP140Q13342 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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SP140Q13342 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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SP140Q13342 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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SP140Q13342 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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