Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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