Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
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COL19A1Q14993 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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COL19A1Q14993 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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COL19A1Q14993 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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COL19A1Q14993 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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COL19A1Q14993 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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COL19A1Q14993 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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COL19A1Q14993 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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COL19A1Q14993 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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COL19A1Q14993 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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COL19A1Q14993 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
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COL19A1Q14993 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
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COL19A1Q14993 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
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COL19A1Q14993 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
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COL19A1Q14993 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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