Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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IFT88Q13099 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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IFT88Q13099 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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IFT88Q13099 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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IFT88Q13099 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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IFT88Q13099 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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IFT88Q13099 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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IFT88Q13099 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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IFT88Q13099 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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IFT88Q13099 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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IFT88Q13099 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFT88Q13099 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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