Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 GRIP1-201ENST00000359742 5216 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 BTN2A1-201ENST00000312541 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 GRAMD2B-212ENST00000513040 2196 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AC008555.1-201ENST00000561778 2757 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AL359220.1-202ENST00000500036 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 CDC27-201ENST00000066544 5801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 THOC5-216ENST00000490103 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 MTTP-208ENST00000511045 3154 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 NR3C2-207ENST00000511528 2967 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 UTY-209ENST00000537580 6490 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 MIR146B-201ENST00000365699 73 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 SCARNA18.2-201ENST00000516882 84 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 MGAT5-202ENST00000409645 8252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 UNC79-206ENST00000621021 7377 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 IL31RA-205ENST00000396836 2426 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 SCN11A-201ENST00000302328 6500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 LRP2BP-201ENST00000328559 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 POGZ-205ENST00000409503 4813 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 GRIK2-207ENST00000421544 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 CHD7-203ENST00000525508 4777 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 ZNF320-201ENST00000391781 6074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 ZNF182-202ENST00000396965 3586 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AL590682.1-201ENST00000437248 344 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 LINC01015-204ENST00000445296 399 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AC020908.2-201ENST00000595134 405 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 PDE4DIP-246ENST00000618462 8150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 CSTF2T-201ENST00000331173 4105 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 MYRFL-205ENST00000552032 3139 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 COL6A5-201ENST00000265379 9214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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