Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
GDE1Q9NZC3 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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GDE1Q9NZC3 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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GDE1Q9NZC3 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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GDE1Q9NZC3 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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GDE1Q9NZC3 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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GDE1Q9NZC3 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GDE1Q9NZC3 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GDE1Q9NZC3 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GDE1Q9NZC3 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GDE1Q9NZC3 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GDE1Q9NZC3 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GDE1Q9NZC3 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GDE1Q9NZC3 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GDE1Q9NZC3 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GDE1Q9NZC3 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GDE1Q9NZC3 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GDE1Q9NZC3 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GDE1Q9NZC3 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GDE1Q9NZC3 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GDE1Q9NZC3 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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