Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 HIVEP2-202ENST00000367603 9724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 SLC16A4-210ENST00000541986 2496 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 CDH18-207ENST00000507958 3542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 SECISBP2L-201ENST00000261847 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 OR11G2-202ENST00000641682 3786 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 ETS1-202ENST00000392668 5139 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 MAPK10-371ENST00000641952 5209 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 LRIG3-202ENST00000379141 3667 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 TBC1D5-209ENST00000429383 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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RNF39Q9H2S5 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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RNF39Q9H2S5 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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RNF39Q9H2S5 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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RNF39Q9H2S5 EMX2OS-206ENST00000551288 7280 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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