Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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