Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
MEIS3Q99687 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms