Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms