Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHHQ15465 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms