Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.5 ms