Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
CDK13Q14004 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDK13Q14004 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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