Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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