Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms