Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CUL3Q13618 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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