Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms