Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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