Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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