Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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