Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ERVV-1B6SEH8 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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