Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms