Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UHRF1Q96T88 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms