Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 ATP2B4-203ENST00000357681 8968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 MYPN-201ENST00000354393 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 TMX2-202ENST00000378312 1521 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 CRNKL1-207ENST00000536226 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
FOXD1Q16676 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms