Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms