Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAMA4Q16363 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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